环保投资是国民经济系统的重要组成部分，对国民经济的发展起着直接的影响作用。本文运用灰色系统关联分析法，选取1995年——2006年的相关指标数据来研究环保投资与工业经济结构优化的关联特征与程度。文章选取整个工业及主要的工业污染行业的增加值作为经济结构的指标，以环境污染治理投资及其三大构成作为测绘环保投资的指标进行研究。研究表明，环境污染治理投资与工业及其内部各行业增加值有较强的关联性，其中工业污染源治理投资的关联度最大，城市环境基础设施建设投资的关联度最小；工业污染源治理投资与化学原料及化学制品制造业、纺织业、饮料制造业、石油加工炼焦及核燃料加工业行业关系最为密切，而建设项目三同时环保投资与医药制造业、食品制造业、电力热力的生产和供应业、造纸及纸制品业存在较紧密的关系。并据此提出了相应的政策建议。