甘蔗杆状病毒同源序列的克隆及分析

来源 :中国植物病理学会2006年学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:forgetyouba
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以采自广西南宁市郊的1株表现褪绿斑点及斑驳症状的甘蔗植株叶片总DNA为模板,根据已报道甘蔗杆状病毒(SCBV)基因组序列设计引物,经PCR扩增,产物克隆及序列分析,获得了一个全长为5364bp的环状核苷酸序列,该序列具有2个完整的开读框(ORF),并与GenBank中已报道的SCBV澳大利亚分离物及摩洛哥分离物的核苷酸及氨基酸序列同源性大于70%,但与SCBV基因组全序列相比,缺失病毒外壳蛋白(coat protein,CP)、天冬氨酸蛋白酶(aspartic protease,AP)、反转录酶(reverse transcriptase,PT)及RNA酶H(RNase H,RH)等Badnavirus属成员基因组保守的功能性序列.推测其为甘蔗基因组中一段SCBV同源序列.
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