高致病性蓝耳病病毒广东分离株ORF5基因的序列分析

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从广东各发病猪场病料中分离到7株高致病性PRRSV,分别命名为GDB1~GDB7。设计一对ORF5基因的特异性引物,应用RT-PCR方法从各PRRSV病毒株中扩增出ORF5基因片段,将其分别克隆到pMD19-T载体上,通过测序分析获得正确的序列。7株PRRSV ORF5基因长度为720bp,共编码201个氨基酸。用DNAStar软件对序列进行分析,同时与经典毒株VR-2332株、LV株、JXA1及周边国家、国内分离株进行核苷酸序列同源性比较,并绘制系统进化树。结果显示GDB1~GDB7与美洲型代表株VR-2332核苷酸序列同源性在87.4%~88.3%之间,推导氨基酸序列同源性在87.1%~88.6%之间;和欧洲型代表株LV相比,核苷酸序列同源性为56.1%~56.6%,推导氨基酸序列同源性为55.7%~56.2%。与最近国内江西、湖南、湖北等地分离的PRRSV相比,核苷酸序列同源性在99%~100%之间,推导氨基酸序列同源性在98.0%~100%之间。从遗传进化树上可看出,7个毒株与Henan-1、SY0608、HEB1、HUN4等毒株亲缘关系较近,与CH-1a、MLVResp、VR2332等毒株亲缘关系较远。
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