论文部分内容阅读
目的:通过病毒分离和序列分析来探究广西猪流感病毒(SIV)的流行及其基因构成情况。
方法:采集疑似临床样品，通过接种SPF鸡胚及MDCK细胞分离病毒，应用RT-PCR扩增分离株HA和NA全基因，并使用分子生物软件对所得序列进行核酸同源性、系统发育进化树分析。
结果:成功扩增A/swine/Guangxi/NNGN3/2009(H1N2)(GN3株)HA、NA基因，和A/swine，Guangxi/LB144，2009(H?N1)(LB144株)NA基因。核苷酸同源性分析表明，GN3株和LB144株分别与北美地区猪源H1N2和欧洲地区猪源H1N1SIV的亲缘关系最近；系统发育进化分析表明，GN3株HA基因位于猪源谱系分支，GN3株和LB144株NA基因则分别位于人源谱系和禽源谱系分支上。
结论:GN3株至少为二重配株，据我们未公布的数据来看已经确认为“人-猪-禽”三重配株，而LB144株则有可能是欧洲型类禽SIV，也是首次在广西分离到的类禽SIV。GN3株与A/swine，Guangxi/13/2006的基因来源相似，表明短期内广西各地已经出现三重配型H1N2 SIV。值得注意的是，期间的2009年甲型H1N1流感在全球暴发，提示建立和完善系统立体的流感监测网络的迫切性和必要性。