呼吸道合胞病毒G蛋白基因序列测定与分析

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目的:掌握浙江地区呼吸道合胞病毒流行株的分子进化及基因变异特点.方法:收集2003-2004年冬季浙江省儿童医院呼吸道感染患儿的鼻咽吸引物,进行病毒分离,对分离株用特异性RT-PCR进行鉴定;对鉴定阳性的RSV毒株进行G蛋白全基因序列测定,并与其他地区RSV分离株的G蛋白基因序列进行同源性比较并构建基因进化树.结果:共分离到4株RSV毒株,3株分离株G蛋白基因全长897bp,另1株为894bp;其中两株的G 蛋白基因序列完全一致;各分离株之间的核苷酸与氨基酸同源性分别为98.05%、97.06%; 与A型RSV毒株标准参考株的核酸同源性为95.69%,与B型RSV参考株的同源性为78.79%;其3’端基因高变区核苷酸序列与GA2亚型的同源性最高.结论:2003-2004年冬季浙江省RSV流行株属于RSV GA2亚型.
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