目的:采用Bruker MS快速鉴别和区分万古霉素耐药肠球菌(vancomycin-resistant enterococci,VRE)和万古霉素敏感肠球菌(vancomycin-sensitive enterococci,VSE)并对该方法的可行性进行评价。方法:收集上海和杭州地区的47株VRE和24株VSE菌株,应用脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)和多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)方法对VRE进行染色体DNA同源性分析,并扩增其万古霉素耐药基因(vanA、vanB、vanC、vanD、vanE、vanG、vanL和vanM型)。ClinProTools 3.0软件对VRE和VSE的峰图进行分析和算法统计。结果:47株VRE菌株涵盖7种ST型,主要为ST78,PFGE显示菌株不同源;20株VRE菌株携带vanA基因,而其余27株携带vanM基因。ClinProTools软件二维图谱显示VRE和VSE的聚集倾向范围存在交叉,VRE样本点较为分散,特异性和灵敏度分别为76.37%和95.65%。4个质荷比分别为2678、3415、5358和6813Da的特征峰可用于区分VRE和VSE,4个峰受试者工作曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)的曲线下面积为0.8-0.9。Bruker MS区分vanA和vanM型VRE特异性和灵敏度为61.32%和93.00%。结论:采用Bruker MS利用特征峰可区分VRE和VSE,灵敏度高但区分特异性不高;Bruker MS对vanA和vanM型VRE菌株的区分效果不理想,有待更多的数据完善改进。