Gene-Based Genome-Wide Association Studies for Bone Weight Trait in Simmental Cattle

来源 :第十五次全国畜禽遗传标记大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:reza777
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  INTRODUCTION Genome-wide association studies (GWAS) typically using single nucleotide polymorphism (SNP) as the basic units of analysis is a convenient strategy of genetic studies and has led to the discovery of many important genetic loci for quantitative traits.However, individual SNP analysis can only account for a small proportion of the genetic variation and offers only a limited knowledge of complex traits. This inadequacy may be overcome by employing a gene-based GWAS analytic approach, which could be regarded as a complementary analysis to the single SNP association analysis.
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引言 畜禽保种的首要目标是最大程度地维持群体遗传多样性,这一目标可通过最小化近交率来实现。近交系数不仅可利用系谱进行计算,还可利用SNP等分子标记进行估计。有研究表明,基于SNP的基因组近交系数(FSNP)可靠性要高于基于系谱的近交系数(Fped) (Kardos et al,2015)。本文借助计算机模拟,以Fped为参照,揭示SNP不同初始基因频率对FsNP衡量遗传多样性准确性的影响,以期为分