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在对中医药抗病原体最低有效浓度普遍太高，而其对机体免疫功能调节及其诱导干扰素生成的结果又与临床脱节等困惑进行综述分析的基础上，采用复杂性科学“非线性理论”对病原微生物感染多因素综合作用、辨证施治与复杂性科学“初始条件”等进行了探讨，认为中医药乃至整个生物医药抗感染研究都要转变科学观念，以复杂性科学为指导，重视各种因素的综合作用及其各自作用的初始条件；中医药辨证施治(状态分析与处理)实质上就是一种多因素综合分析法，应该强化对它的认识与临床研究。