家族性高胆固醇血症患者LDLR基因全长cDNA序列方法建立及应用

来源 :第十二次全国动脉硬化性疾病学术会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ssgriian
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  研究背景 家族性高胆固醇血症(FH)是一种严重的常染色体显性单基因遗传性疾病,其主要特点为血浆低密度脂蛋白胆固醇(LDLC)水平极度升高、皮肤和肌腱黄色瘤、早发冠心病.FH的主要病理基础是LDLR基因突变,目前为止已报道有1 000余种突变,2/3为点突变,1/3为内含子突变、移码突变、大片段插入或缺失.目前FH的基因诊断传统方法是采用逐一LDLR基因外显子DNA序列的方法,而有可能忽视或未发现同义突变和内含子突变,外显子和内含子的突变可能引起前信使RNA剪接缺陷,致使临床确诊的FH患者中仍有15% ~ 30%检测不到突变.国外报道,直接分析患者全长cDNA序列有可能检测到一些基因组DNA检测不到的突变.由于受到mRNA取材及测序长度的限制,目前国内尚未见相关报道.目的 为深入研究FH患者隐藏的LDLR基因突变,设计合成LDLR基因相互重叠的引物序列,建立LDLR基因全长cDNA序列的方法,检测DNA测序未检测出突变的FH患者cDNA,证实本方法的可靠性,为FH的基因诊断提供新的方法依据.方法 (1)参考文献报道,设计合成LDLR基因相互重叠的引物序列.(2)收取正常健康人外周血,试剂盒提取总RNA,逆转录成cDNA,采用本室建立的"Touchdown"扩增程序进行扩增,对产物进行正、反双向核苷酸序列分析,拼接LDLR基因全长cDNA序列,并与Gen-Bank比对,证实全长cDNA序列正确无遗漏.(3)收集临床确诊的FH但传统方法检测不到LDLR基因突变的患者为研究对象,提取患者外周血的RNA,逆转录成cDNA,采用上述5对引物扩增、拼接、比对,证实患者突变的类型,以验证此方法的可靠性.结果 (1)已合成LDLR基因相互重叠的引物序列,分为5段(对应外显子1~8、3~10、7~14、11 ~17、13 ~ 18).(2)正常人cDNA测序结果显示5个扩增产物序列与GenBank比对均无遗漏,且相互之间交叉重叠,拼接后再次与GenBank比对,与LDLR基因的1 258对碱基完全一致,无遗漏.证实了此方法可靠.(3)一名临床确诊FH但传统方法检测不到LDLR基因突变的患者,cDNA测序结果显示其LDLR基因全长cDNA序列可完全拼接,且发现内含子3:313+1位置一个隐藏的剪切位点突变.结论 LDLR基因全长cDNA序列方法的建立,使得符合FH临床诊断但DNA测序基因筛查未发现ApoB100和LDLR基因突变的患者,通过全长cDNA测序可发现其突变位点,且该突变可能是FH发病的分子基础并导致其严重的临床表型.LDLR基因全长cDNA序列方法可用于识别潜在的遗传缺陷.
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