【摘 要】
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由子囊菌(Magnaporthe oryzae)引起的稻瘟病,是为害水稻粮食生产的主要病害之一,长期对水稻稳产构成威胁.抗性品种是防治稻瘟病的主要有效手段之一.然而,由于稻瘟病菌群
【机 构】
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中国农业大学植物保护学院,北京 100193
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由子囊菌(Magnaporthe oryzae)引起的稻瘟病,是为害水稻粮食生产的主要病害之一,长期对水稻稳产构成威胁.抗性品种是防治稻瘟病的主要有效手段之一.然而,由于稻瘟病菌群体的变异,水稻品种推广后往往抗性逐步丧失.为深入了解稻瘟病菌的变异规律,有效利用抗病品种,本研究利用高通量测序技术对采自东北稻区的31个菌株及南方稻区的22个菌株进行测序,并利用生物信息学软件对稻瘟病菌的变异因子SNP进行分析.通过与稻瘟病菌MG8参考基因组比对发现,所检测稻瘟病菌株SNP位点数量占整个基因组大小的0.2％；菌株间比对发现,南北方菌株之间的差异(SNP位点数)通常较南方或北方内部菌株间的差异大.但是也有少数菌株例外,例如,南方几个菌株与北方的菌株之间的差异(SNP位点数目)小.SNP注释结果显示,大部分菌株的Ka/Ks略大于1,显示稻瘟病菌受到正向选择压力的影响.SNP位点分析的这些结果为进一步了解稻瘟病菌的进化打下了基础.
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