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目的：对益气活血润肠法治疗功能性便秘的临床疗效进行观察，并探讨对肠转运功能的药理作用。方法：以120例均为2009-2011年12月中国中医科学院广安门医院脾胃病科门诊及病房的患者为研究对象。结果：治疗组证候疗效的痊愈率和总有效率高于对照组，差异有统计学意义(p＜0.05)，提示益气活血润肠方在改善患者证候方面优于对照药芪蓉润肠口服液。治疗组结肠运输试验有效率高于对照组，差异有统计学意义(p＜0.05)。结论：益气活血润肠法治疗功能性便秘优于对比的芪蓉润肠口服液，能明显改善患者便秘等临床症状，且能缩短结肠传输时间，有利于便秘的治疗。