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目的:应用寡核苷酸基因芯片技术,构建冠心病血瘀证患者差异基因表达谱,并通过目标基因鉴定,对目标基因的临床意义进行了初步探讨。
方法:筛选符合冠心病、血瘀证、健康人入选标准的冠心病血瘀证组、冠心病非血瘀证组、非冠心病血瘀证组和健康对照组各8例为芯片实验的研究对象。留取静脉血,分离白细胞,抽提RNA,经质控芯片对样本质量进行检测后,与AffymetrixU133 Plus 2.0芯片进行杂交。通过扫描和软件分析,筛选冠心病、血瘀证相关差异基因,构建冠心病血瘀证差异基因表达谱,并进一步对差异基因进行基因本体和通路分析。结合疾病病理生理和文献研究确定目标基因,使用实时荧光定量逆转录聚合酶链反应法对目标基因进行鉴定。筛选冠心病血瘀证患者30例和健康对照者40例(标准同上),采用ELISA法验证目标基因IL-8的临床相关性。
结果:通过差异基因筛选,与冠心病相关的差异基因共有107个,其中上调48个,下调59个;与血瘀证相关的差异基因共有48个,其中上调26个,下调22个。冠心病相关差异基因中分子功能和生物学途径涉及炎症免疫反应的有14个,占13.1%;通路显著性分析发现,冠心病相关有意义通路共15个,其中有4个涉及炎症和免疫反应。血瘀证相关差异基因中分子功能和生物学途径与炎症免疫反应相关的有5个,占10.4%;通路显著性分析,发现血瘀证相关有意义通路共10个,其中有5个涉及炎症和免疫反应。目标基因RT-PCR结果的差异倍数与基因芯片检测结果不完全相同,但变化方向均一致,证明基因芯片结果准确可靠。冠心病血瘀证组血清IL-8浓度为(83.21±34.33)pg/mL,健康对照组血清IL-8浓度为(63.34±36.36)pg/mL,冠心病血瘀证组血清IL-8水平显著高于健康对照组(P<0.05)。
结论:从核酸水平揭示了冠心病血瘀证与炎症免疫反应的相关性,目标基因IL-8与冠心病血瘀证密切相关。