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为解决IEF/SDS-PAGE在多亚基大分子复合物分离上的缺陷，本文利用蓝绿温和凝胶电泳(BN-PAGE)技术得知复合体的大小、数量、组成、相对丰度等理化参数。BN-PAGE以考马斯亮蓝G-250代替SDS使蛋白质复合物带负电荷，用温和的去污剂，如DM, TritonX-100和Brij96等增溶膜蛋白复合物。在类囊体膜蛋白质复合物的分析研究中，可以分离10kD到10MD的蛋白，并使复合物以近似天然的形态分离，可以真实反映叶绿体蛋白质复合物的情况。