通过免培养的分子生物学方法,对竹鼠盲肠的微生物多态性进行初步的探索性研究,从而为竹鼠消化道微生物的多态性和微生物的分离纯化以及功能性基因的克隆提供相关的理论依据。从竹鼠盲肠中提取微生物的总DNA,用细菌通用引物F27/R1492扩增出细菌16S rDNA的基因,构建16S rDNA基因文库。用HaeIII和Hha I两种限制性内切酶对阳性克隆子的扩增产物进行酶切,挑选不同的OUT(操作分类单位)测序,通过Blast在线比对,选择相似度较高的若干个序列构建系统发育树,比较代表克隆子基本分类种群和生物多样性的构成。竹鼠盲肠中有着丰富的微生物菌落分布,其中大部分是未培养或未知的菌株,在分类学上具有潜在意义的被选菌株,而且存在可能和脂肪代谢有关的微生物群体。同时也有乳酸菌属、芽孢杆菌属、梭形杆菌属和多粘类芽孢杆菌的分布。竹鼠盲肠中细菌菌落有较高水平的多样性,而且其中的大部分是未培养或未知的菌群,这些菌群可能和竹鼠脂肪含量高有着密切的关系,而且竹鼠的食物以粗纤维为主,所以这些菌群中很可能存在纤维降解菌,但是需要进一步的证实。