枣CNGC家族基因鉴定及其响应生物和非生物胁迫表达分析

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枣(Ziziphus jujuba Mill.)抗干旱、耐瘠薄、耐盐碱等优点突出,在干旱盐碱地区增收致富和生态建设中具有重要地位。环核苷酸门控离子通道(CNGC)在植物器官生长发育、信号传导和对逆境胁迫响应等方面发挥重要作用。对枣中CNGC基因家族进行鉴定,并对其响应逆境胁迫进行表达分析,为解析CNGC基因调控枣树抗逆境胁迫机制提供理论基础。基于枣基因组数据库,利用一系列生物信息学分析方法对枣CNGC基因进行鉴定及对其染色体定位、基因结构、启动子顺式作用元件和聚类分析;以‘灌阳长枣’愈伤组织为试材进行低温、盐、碱非生物胁迫处理,对‘冬枣’患枣疯病叶片进行生物胁迫处理,利用qRT-PCR技术对其响应逆境胁迫进行表达模式分析。在枣基因组中共鉴定出15个CNGC基因,其分布于枣的7条染色体上,并根据其在染色体中的位置命名为枣CNGC1~CNGC15。系统发育分析表明,枣CNGC可分为4个亚组,其中第4亚组又可分为ⅣA/B,ZjCNGC12属于ⅣA组,ZjCNGC13/14/15属于ⅣB组。此外,ZjCNGC15在进化过程中发生了直系同源性复制。基因结构分析发现ZjCNGC1~ZjCNGC15在外显子/内含子数量及翻译后修饰方面表现出相似的结构特性和功能。启动子顺式作用元件预测分析发现CNGC基因序列启动子区域存在响应逆境胁迫相关作用元件。实时定量PCR分析发现,ZjCNGC4/15在低温、盐、碱非生物胁迫过程中显著上调,而ZjCNGC10/13/14显著响应植原体侵染的生物胁迫,表明这些基因在枣树响应逆境胁迫过程中发挥重要作用。
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