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骨干亲本在育种改良中具有关键性作用。为充分挖掘并发挥骨干亲本川麦44在育种及基础研究中的利用价值,解析其遗传基础,本研究利用小麦660KSNP芯片技术及亲缘系数法,分析了川麦44遗传构成、双亲贡献及与衍生品种的亲缘关系。结果表明,川麦44与其双亲存在388727个共有标记位点,占71.32%;来自96夏440的特异位点数有88847个,占16.3%;来自贵农21的特异位点数仅41085个,占7.54%;而川麦44特异位点数高达26358个,占4.84%。川麦44更多继承了自育亲本96夏440的遗传物质,遗传相似度高达87.62%(71.32%+16.3%),遗传贡献为68.38%;外来亲本贵农21的遗传贡献为31.62%。川麦44与10个衍生品种相互间均存在亲缘关系,COP值变化范围在0.125-0.5625之间,亲缘系数总和35.625,平均值0.35625;聚类结果与系谱来源一致;川麦44与川麦66、川麦68距离最近,与川麦601距离最远。本文还就观察到的一些现象进行了思考:(1)同一物种不同个体间,在自然进化或人工育种过程中,保留相当大比例的共同部分,这些遗传结构共同部分是物种之所以成其为物种的基础,也可能受选择牵连影响,蕴藏着重要遗传信息;(2)采用多态性标记进行遗传构成研究,获得的结果仅是从遗传物质多少上划分出相应比例,难以准确反映功能调控的贡献。