【摘 要】
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<正> 核酸和蛋白质序列的相似性分析是生物信息学的重要内容,也是几乎每个分子生物学研究工作者的日常工作之一.联网到美国国家生物技术信息中心(NCBI)使用Blast软件进行核酸
【机 构】
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军事医学科学院放射医学研究所基因组学与蛋白质组学研究室;
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<正> 核酸和蛋白质序列的相似性分析是生物信息学的重要内容,也是几乎每个分子生物学研究工作者的日常工作之一.联网到美国国家生物技术信息中心(NCBI)使用Blast软件进行核酸和蛋白质序列对库检索是最常用的分析方法.但是,这种方式只能对NCBI所提供的数据库进行序列相似性分析.国外和国内已有多家实验室在从事大规模测序过程中积累并建立了自己的核酸序列数据库.通常方式下,对这些自行建立的数据库的相似性分析一般使用Telnet程序登录到相应的服务器后在局域网环境下使用Blast等软件进行对库检索,使用十分不方便.事实上,NCBI同时提供了能够通过WEB界面进行数据分析的Blast程序.本文报道如何以低价位的PC机和免费的Linux操作系统为基础构建Blast分析系统的WEB界面的方法及其应用.具体的实现过程包括几个方面:安装并配置基于PC/Linux操作系统的局域网络,下载WER界面的Blast软件,下载有关数据库(如EMRI或GenRank核酸序列数
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