Lys63连接的二聚泛素蛋白的构象空间分析

来源 :中国化学会第十八届全国有机分析及生物分析学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ontrackfor19888
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
两个或多个泛素蛋白之间可以异肽键连接,缩合形成二聚及多聚泛素蛋白.不同共价连接方式的泛素蛋白可以和不同的靶蛋白特异性识别,进而行使不同的功能.Lys63连接的泛素蛋白参与了DNA损伤修复及NF-κB的信号传导.通过对泛素亚基间的顺磁弛豫增强(PRE)数据进行模拟退火优化,分析了以Lys63连接的二聚泛素蛋白的构象空间.发现在没有与靶蛋白存在时,大约有70%的蛋白处于关闭的状态,两个共价连接的泛素亚基发生相互作用,另有30%的蛋白处于打开的状态.进一步分析发现,Lys63连接的二聚泛素蛋白同时存在有两种不同的关闭状态,比例为3: 1。打开和两种关闭的结构分别对应有不同的靶蛋白,并且与靶蛋白结合的强度是由预先存在的结构比例所决定的。通过顺磁核磁、定点突变、热力学分析,Lys63连接的二聚泛素蛋白通过构象选择的机制与靶蛋白之间进行特异性识别。
其他文献
一般情况下,有分离检测和非分离检测,如旋光、核磁共振、热分析等属于非分离检测法;而目前常用的气相色谱(GC)、液相色谱(LC)和毛细管电泳(CE)等则属于分离检测法。本文利用毛细管区带电泳,结合SCF。作为手性选择剂,分离研究了两种西酞普兰类似物,并对其分离条件进行了优化。在pH=3.0,lOOmM Tris的背景电解质溶液条件下,西酞普兰类似物能很好的得到有效分离。令人满意的分离效果能更好的体现
目的:对裸蒴中微量同分异构体进行快速的区分.方法:通过探针电喷雾串联质谱以及质谱裂解曲线对裸蒴中微量的同分异构化合物进行检测.结果:建立了一种快速可靠的区别微量同分异构体的方法.结论:结合探针电喷雾质谱以及质谱裂解曲线对天然产物中微量同分异构成分的检测与区分具有应用价值.
建立了毛细管电泳法同时检测面粉中偶氮甲酰胺及其降解物氨基脲.通过对电泳条件、衍生化反应及样品前处理进行优化,实现了同时分离测定面粉中偶氮甲酰胺和氨基脲,且方法分离效率高、操作简单、快速.本法用于面粉中偶氮甲酰胺及氨基脲的分离检测,峰面积及迁移时间相对标准偏差均小于2%(n=5),回收率为85.46-109.90%,定量限(S/N=10)分别为0.5mg kg-1和0.15mg kg-1.方法可用于
由于核磁共振波谱检测具有方便、简单、快速、环境友好等优点,同时随着小型化、微型化核磁共振的发展和普及,基于NMR方法的手性识别及ee值的测定越来越受到化学家的青睐,它能够观测到手性分子中每一个功能基团在手性识别过程中的表现,能清晰地表明主客体相互作用的位点,并且可以预测非对映体络合物的空间构象.一般说来,NMR主要借助于化学位移、耦合常数、弛豫时间、NOE、扩散系数等参数来研究手性识别.在研究手性
基于Hg2+调控赖氨酸修饰的纳米金(Lys-AuNPs)的聚集,建立了简单、灵敏的黄曲霉毒素B1(AFB1)可视化检测的方法.方法的线性范围在5nM至100nM之间,检测限为3.6nM,.方法对其他真菌毒素有很好的选择性,可应用于大米等食品样品中AFB1的定量检测.
近年来北京市大气环境持续恶化,大气雾霾现象越来越严重,而科研界对北京市大气雾霾的主要污染来源众说纷纭,未达成统一定论.本文摒弃传统研究大气PM2.5来源所利用的源解析方法,从北京市日均燃油消耗量、燃油质量及机动车尾气实际排放量角度出发,系统地研究了机动车尾气此单一来源对北京市大气PM2.5的贡献率.通过本文研究发现,北京市燃油普遍存在重金属含量、芳烃含量、硫含量超标以及氮含量高等质量问题,这些都将
质子化的2-卤代N,N-二甲基乙胺类化合物在电喷雾串联质谱中发生特征的分子内卤素迁移反应,即卤素从烷基链上迁移到氮上,同时丢失一分子乙烯.实验发现C1,Br和I都会发生这样的迁移反应,而F则不会发生迁移反应.进一步的实验和理论计算推测该类化合物在裂解反应过程中会形成一个[二甲胺/卤鎓离子]中间体,通过该中间体,卤素可以迁移到二甲胺上.
将分析化学与临床医学结合,发展高特异的多肽、蛋白质、基因等功能生物分子的灵敏检测和疾病诊治新方法是生命分析化学的重要研究方向.近两年来,以癌症早期诊治为目标,采用纳米与分子生物学技术,设计仿生识别体系,提出了系列性信号放大策略,构建了一系列具有信号放大与识别功能的光学或电化学示踪探针;通过光电传感与分子成像,发展了多种高通量、高特异性及高灵敏度的DNA、microRNA与蛋白质分子等肿瘤标志物的检
纳米通道单分子水平分析技术是在一个纳米尺寸的孔道(固体孔或生物成孔蛋白质Hemolysin、Aerolysin等)的两侧施加电压,在电场的作用下,待测分子通过孔道.当分子通过孔道,分子排挤孔道里的溶液和离子,进而造成离子流的变化,即造成电导率的变化.离子流阻断程度和阻断时间等信号可反映分子的结构特征信息.课题组在搭建的集超微电流采集与数据分析于一体的高灵敏纳米通道单分子检测装置上,实时监测由弱相互
随着蛋白质组学研究和生物质谱技术的进展,尤其是差异蛋白质组学和靶向蛋白质组学研究的进展,基于质谱的候选蛋白质标志物的挖掘和验证策略已经成为疾病候选蛋白质标志物研究的重要策略.差异蛋白质组研究主要是通过质谱技术对不同生理状态下组织或体液中的蛋白质进行相对定量,从而大规模地挖掘到差异表达的蛋白质.所采用的方法的准确度,精密度,灵敏度和通量直接决定了挖掘到的差异蛋白质的种类和准确性.