两个萝卜种质抗黑腐病基因的QTL-seq分析

来源 :中国园艺学会2017年学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:huiyigng
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  为了挖掘萝卜多样性抗黑腐病基因,通过分子设计育种培育具有持久抗性的新品种.同时以抗病基因为中心深度解析植物对黑腐病菌抗性机理,为制定有效的抗病遗传改良策略和病害综合防治措施提供理论依据.以两个高抗黑腐病材料P22、P24和1个感黑腐病材料P33为亲本,分别构建了两个F2群体(P22xP33,P24×P33).利用剪叶法和喷雾法相结合对F2群体进行单株表型鉴定.依据表型鉴定结果,在两个群体中分别选取表型高抗和高感的F2单株各50株,单株提取DNA后等量混合,4个极端混池进行QTL-seq测序,同时对3份抗、感亲本材料进行重测序.以公布的萝卜基因组为参考,分别计算4个抗、感池的SNP-index,并计算抗、感池之间的△SNP-index,获得抗病性状位点区间,并对定位区间内的基因进行初步分析.分析结果表明:在P22 x P33的F2群体中,将抗病性状位点初步定位于2号染色体上两个区域(26.25~30.55 Mb和33.2~33.65 Mb,置信区间为95%);在26.25~30.55 Mb区间内有两个含有NBS结构域抗病基因Rsa10012347和Rsa10012342.P24 x P33 的F2群体中,抗病性状位点初步定位在7号染色体前半部分两个区域(0.95~5.15 Mb和6.6~15.45 Mb,置信区间为99%).0.95~5.15 Mb区域含有1个NBS基因Rsa10031067,6.6~15.45 Mb区域含有9个含NBS结构的基因.其中Rsa10023419、Rsa10023420、Rsa10023421、Rsa10023422、Rsa10023423、Rsa10023424、Rsa10023425为串联重复基因簇,Rsa10009783和Rsa10009784也为串联重复基因.在已经克隆的植物抗病基因中,大约80%属于NBS基因家族,因此推测这些基因可能与萝卜抗黑腐病有关.
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