北京地区急性散发性戊型肝炎中戊型肝炎病毒基因型及亚型分布

来源 :第四届全国免疫诊断暨疫苗学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lnlsq
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为了解北京地区急性散发性戊型肝炎患者感染的戊型肝炎病毒(HEV)基因型和亚型分布,本文采用实时荧光PCR的方法检测93例急性散发性戊型肝炎患者粪便标本,并对阳性粪便标本应用RT-PCR方法扩增HEV RNA开放读码框架2(ORF2)部分序列,进行克隆测序,利用生物信息学软件进行基因型和亚型分析。结果显示,93例急性戊型肝炎患者粪便标本经实时荧光PCR方法检测52份阳性(55.91%)。RT-PCR获得的41个克隆核苷酸序列同源性为83.3%~100%,与Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型、Ⅳ型HEV参考序列的同源性分别为77%~80.5%,78.6%~81.2%,76.7%~81%,83.3%~93.7%,41例均属于基因Ⅳ型。进化树分析提示41例可能属于3个基因亚型,6例为Ⅳa亚型,34例属Ⅳb亚型,另外1例(ya30)属于Ⅳ型,但单独形成一个亚型分支,可能为一个新的亚型。提示北京地区的急性散发性戊型肝炎中HEV属于Ⅳ型,但可能有不同的基因亚型。
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